Nadzór nad Biblioteką sprawuje Prorektor ds. Nauki. Biblioteką kieruje Dyrektor, powoływany przez Rektora AGH na kadencję, która trwa 4 lata i rozpoczyna się w dniu 1 stycznia roku następującego po roku, w którym rozpoczęła się kadencja Senatu.
Dyrektor Biblioteki jest z upoważnienia Rektora AGH przełożonym wszystkich pracowników BG AGH.
Do jego kompetencji należy w szczególności:
Na czas nieobecności Dyrektora Biblioteki jego obowiązki pełni jeden z jego zastępców. Zastępców Dyrektora BG — w liczbie nie większej niż dwóch — powołuje i odwołuje Rektor AGH na wniosek Dyrektora. Zastępcy Dyrektora BG AGH podlegają bezpośrednio Dyrektorowi i kierują powierzonymi im sprawami i działalnością nadzorowanych przez nich wewnętrznych jednostek organizacyjnych, zgodnie z zakresem obowiązków.
Poszczególnymi jednostkami wewnętrznymi BG AGH kierują Kierownicy powoływani na 4-letnią kadencję. Powołania do pełnienia funkcji i odwołania z niej dokonuje Rektor AGH na wniosek Dyrektora BG AGH. Kierownicy jednostek wewnętrznych BG AGH podlegają bezpośrednio Dyrektorowi BG AGH lub odpowiedniemu zastępcy i są przed nimi odpowiedzialni za właściwe kierowanie powierzonymi im jednostkami.
Do kompetencji kierowników jednostek wewnętrznych Biblioteki w szczególności należy: